Integrative SMR prioritizes oxidative stress-related regulatory genes for Alzheimer's disease with brain-tissue validation - PubMed
2 months ago
- #Alzheimer's disease
- #Mendelian randomization
- #Oxidative stress
- 整合性SMR分析优先筛选出与阿尔茨海默病（AD）相关的氧化应激调控基因
- 氧化应激（OS）在AD发病机制中起关键作用，但其遗传表观调控机制尚不明确
- 研究采用三步法基于汇总数据的孟德尔随机化（SMR）框架，整合AD全基因组关联研究统计量与eQTL、mQTL数据集
- 通过GTEx v8和AMP-AD数据库评估脑组织相关性
- 最终确定的OS相关候选基因包括CRLS1、PRKAA1、CYP2E1、GPX1和APP
- 脑组织区域分析发现KEAP1、SIRT1和PRDX5具有区域特异性信号
- 功能富集分析揭示了'Nrf2介导的抗氧化反应'和'PI3K-AKT信号通路'等关键通路
- 在甲基化位点发现新型调控机制，揭示了表观遗传调控与转录机制的关联
- 该研究为AD分子机制提供新见解，并识别出潜在治疗靶点