Trimodal single-cell profiling of transcriptome, epigenome and 3D genome in complex tissues with scHiCAR - PubMed
2 days ago
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- scHiCAR是一种用于转录组、表观组和三维基因组三模态单细胞分析的方法。
- 它能从同一批细胞中同步分析mRNA、开放染色质和染色体构象捕获数据。
- 与现有技术相比，scHiCAR能更高效地富集以候选顺式调控元件为锚点的长程顺式相互作用。
- 该方法应用于162万个小鼠脑细胞时，能以5kb分辨率定义细胞类型特异性转录组、可及性顺式调控元件及增强子-启动子对。
- scHiCAR在骨骼肌等复杂组织中表现稳健，可用于分析肌肉干细胞再生过程中的基因调控动态。
- 该方法为复杂组织的基因调控景观单细胞三模态分析提供了可扩展且经济高效的研究体系。