Functional role of small extrachromosomal circular DNA in colorectal cancer - PubMed
10 days ago
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- 小肠外染色体环状DNA（eccDNA）在结直肠癌肿瘤中比邻近正常组织中更丰富，与染色体扩增相关。
- 在1.29%的eccDNA上发现的完整基因是非随机的，其中84个基因在患者中重复出现；这些基因中有19%与癌症相关，且常显示出表达增加。
- eccDNA携带的基因对基因表达的贡献大于线性扩增或更大的染色体外DNA（ecDNA），例如细胞因子CXCL5驱动上调并招募免疫细胞。
- eccDNA优先在开放染色质和活跃转录位点形成，边界由CTCF蛋白标记，更高的eccDNA水平与患者更差的无复发生存期相关。