Nucleotide-resolution mapping of regulatory elements via allelic readout of tiled base editing - PubMed
2 months ago
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- 介绍一种用于调控元件核苷酸分辨率定位的端到端实验检测与计算流程
- 采用密集碱基编辑诱变后对CRISPR引入等位基因进行靶向测序
- 以CD19增强子为概念验证，鉴定出调控CD19表达的关键等位基因与核苷酸
- 可视化工具揭示了与最高评分核苷酸对应的转录因子结合基序
- 证实MYB、PAX5和EBF1结合位点的突变会降低CD19表达
- 编辑MYB和PAX5基序可赋予CD19 CAR-T细胞疗法抗性，表明非编码变异可驱动免疫治疗逃逸
- 该方法实现了超越传统gRNA筛选的核苷酸分辨率基因型-表型定位