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Development and validation of an interpretable machine learning model identify the lactylation-related protein SUSD3 as a prognostic and therapeutic biomarker for breast cancer - PubMed

3 months ago
  • #breast cancer
  • #lactylation
  • #machine learning
  • 开发可解释的机器学习模型以鉴定乳酸化相关蛋白SUSD3作为乳腺癌生物标志物
  • 乳酸化作为一种翻译后修饰与癌症进展和免疫调节相关,但其在肿瘤发生中的确切作用尚不明确
  • 研究利用公共数据库中的单细胞RNA测序、批量转录组数据和空间转录组等基因组数据集
  • 通过机器学习构建了乳酸化相关特征谱,该特征与免疫细胞浸润、趋化因子表达及肿瘤突变负荷相关
  • 该特征谱有助于识别可能对免疫治疗产生应答的乳腺癌患者
  • 实验验证证实了SUSD3在人类乳腺样本中的作用
  • 乳酸化风险模型可预测乳腺癌的恶性进展和免疫逃逸,具有作为治疗靶点和诊断标志物的潜力
  • 该模型为适用于其他疾病和致病机制的基因筛选提供了框架