SkewDB - Bert Hubert's writings
a day ago
- SkewDB是一个免费数据库，包含超过53,000条染色体和质粒的GC及其他偏斜数据，最后更新于2024年7月5日，现包含均聚物计数和密码子偏斜数据。
- 该数据库使用开源Antonie软件创建，基于NCBI的公共DNA序列、注释和分类学数据，为每条染色体提供具有4096个核苷酸粒度的独立文件。
- 主要特征包括偏斜梯度（如GC、TA、链偏斜）字段、密码子位置分析、分类学分类以及拟合质量指标，该项目旨在支持GC偏斜和染色体行为的研究。