A Science Experiment: part 2 - Bert Hubert's writings
a day ago
- 创建并发布了SkewDB，这是目前最大的综合数据库，涵盖25,000个细菌染色体的GC/TA偏斜信息。
- 将处理120GB公共NCBI数据以生成该数据库的软件开源。
- 提供了一个Jupyter笔记本，方便对数据集进行探索和绘图。
- 发现了一种预测厚壁菌门细菌GC/TA偏斜的方法，可能解决现有争议。
- 识别出数十种存在无法解释的不对称性的细菌，包括没有GC偏斜的链以及链大小不均的情况。
- 认识到开放数据共享的重要性，并计划发布预印本以供同行评审。