A Science Experiment: part 2 - Bert Hubert's writingsa day agohttps://berthub.eu/articles/posts/a-science-experiment-part-2/创建并发布了SkewDB,这是目前最大的综合数据库,涵盖25,000个细菌染色体的GC/TA偏斜信息。将处理120GB公共NCBI数据以生成该数据库的软件开源。提供了一个Jupyter笔记本,方便对数据集进行探索和绘图。发现了一种预测厚壁菌门细菌GC/TA偏斜的方法,可能解决现有争议。识别出数十种存在无法解释的不对称性的细菌,包括没有GC偏斜的链以及链大小不均的情况。认识到开放数据共享的重要性,并计划发布预印本以供同行评审。