Patient-specific alterations in blood plasma cfRNA profiles enable accurate classification of cancer patients and controls - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41792470/研究通过分析血液血浆cfRNA谱区分癌症患者与对照组在25种癌症类型中分析266份样本，并在独立队列中进行额外验证发现患者存在癌症类型特异性及普遍的cfRNA改变鉴定出在个体患者中与对照组差异显著的'生物标志物尾部基因'每个样本中变异基因数量有助于区分癌症与对照样本该方法在前列腺癌和淋巴瘤等多个队列中得到验证凸显了利用患者特异性RNA模式进行个性化癌症检测的潜力
Non-invasive blood-based detection of endometriosis can improve standard-of-care by facilitating early diagnosis and clinical management among symptomatic women - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41791702/无创血液检测子宫内膜异位症通过实现早期诊断和临床管理提升标准诊疗水平研究旨在开发并验证一种基于血液的子宫内膜异位症诊断方法，确保其在月经周期各阶段均保持准确性采用机器学习分类和独立队列验证的多中心病例对照研究，纳入298名育龄期女性该检测通过随机森林模型整合了microRNAs、蛋白质生物标志物、类固醇激素、年龄和BMI数据在独立验证队列中取得AUC 0.944、灵敏度0.80、特异度0.975的优异表现月经周期各阶段性能稳定：增殖期（AUC 0.935）和分泌期（AUC 0.993）识别出61.5%经组织学确诊但被经阴道超声和MRI等影像学检查漏诊的子宫内膜异位症病例有望改善早期检测并指导及时临床干预，目前正在多样化人群中进行前瞻性验证
Integrative Molecular Insights Into Epidemiological, Genetic, and Metabolic Risk Factors of Gallbladder Cancer: Implications for Biomarkers, Therapeutic Targeting, and Future Perspectives - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41804759/胆囊癌（GBC）是一种罕见但高度恶性的肿瘤，其五年生存率不足5%。胆囊癌的危险因素包括地域差异、遗传易感性、环境暴露、慢性炎症和感染。代谢重编程是胆囊癌发生的核心驱动因素，涉及脂质代谢改变、胆汁酸信号传导和氧化还原失衡。胆囊癌的关键分子通路包括NF-κB激活、氧化应激、PI3K/AKT介导的代谢重塑及DNA损伤修复缺陷。本综述强调了胆囊癌在生物标志物发现、代谢成像、早期检测和靶向治疗开发方面的机遇。
CDH1, CAV1, NR3C1, and ZEB1 are Potential Biomarkers in Colorectal Cancer Drug Resistance and Prognosis - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41804278/CDH1、CAV1、NR3C1和ZEB1被确定为结直肠癌（CRC）耐药性和预后的潜在生物标志物。研究利用生物信息学分析（GEO数据库GSE153412）筛选5-FU耐药与敏感CRC细胞间的差异表达基因（DEGs）。通过基因集富集分析（GSEA）、WGCNA和PPI网络鉴定耐药相关模块与枢纽基因。关键基因（CAV1、CDH1、CXCL8、CD24、NR3C1、ZEB1）在TCGA-COAD数据集中显示与CRC预后相关。临床验证证实CDH1、CAV1、NR3C1和ZEB1在CRC样本中的异常表达，支持其在耐药通路中的作用。
Cerebrospinal fluid NPTX1 and NPTXR predict neurodegeneration and clinical progression in Alzheimer's disease - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41803142/脑脊液中NPTX1和NPTXR水平是阿尔茨海默病严重程度和进展的重要指标脑脊液NPTX水平降低与AD易损脑区的认知功能障碍和皮质变薄相关基线NPTX水平可预测更快的脑萎缩及从轻度认知障碍向痴呆的转化NPTX生物标志物常优于或补充传统标志物（如pTau181和神经丝轻链）这些标志物可优化临床试验中的患者分层及疾病修饰疗法的疗效监测
The limitations of biomarkers in addressing bias in alcohol and cardiovascular disease research - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41128004/本文探讨了生物标志物在解决酒精与心血管疾病研究中偏倚问题时的局限性。文章引用了I. Domínguez-López等人题为《尿液中酒石酸作为葡萄酒摄入及心血管风险生物标志物：PREDIMED试验》的研究。所有作者均声明此项研究无利益冲突。该论文发表于《欧洲心脏杂志》，数字对象标识符：10.1093/eurheartj/ehaf548。
Plasma Phosphorylated Tau 217 and Incident Mild Cognitive Impairment and Dementia in Older Women - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41805953/血浆磷酸化tau217蛋白(p-tau217)水平升高与老年女性轻度认知障碍(MCI)和痴呆发病相关该研究纳入2766名65-79岁女性，25年随访期间1311人发展为MCI或痴呆p-tau217水平每升高1个标准差，MCI或痴呆风险增加2.43倍(HR:2.43)这种关联在70岁以上、携带APOE ε4等位基因及白人女性中更为显著（相比黑人女性）p-tau217与黑人女性MCI无显著关联，但年龄与p-tau217联合预测模型在白人和黑人女性中具有相似效力激素治疗(雌激素+孕激素)会增强p-tau217与痴呆的关联(HR:4.18 vs 安慰剂组3.07)研究表明p-tau217可作为认知衰退的长期预测指标，其预测效力受年龄、种族、APOE ε4状态及激素治疗影响
Implementing plasma p-tau217 and cognitive testing for Alzheimer's screening in low-education populations in central China - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41804834/在一项老年健康筛查队列中，评估了结合简易认知评估与血浆p-tau217检测的实用筛查策略。采用记忆与执行功能筛查（MES）测试和血浆生物标志物评估识别认知障碍。认知障碍的界定采用基于内部参照样本的个体化残差常模。p-tau217阈值设定以阳性预测值为导向，并锚定年龄及认知状态特异性Aβ病理先验概率。12.4%的参与者检出MES定义的认知障碍（≥-2个标准差）。在认知未受损个体中，针对0.7阳性预测值的年龄特异性阈值使p-tau217总体阳性率达11.8%。认知受损参与者中26.6%呈p-tau217阳性。基于回归的残差法减少了教育程度偏差。全自动化学发光检测技术实现生物标志物的大规模实际应用。该简易筛查策略有助于早期发现、临床试验招募及资源匮乏地区的资源优化配置。
Intrathecal immunoglobulin production in the diagnosis, prognosis, and monitoring of autoimmune diseases of the central nervous system - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41799306/鞘内免疫球蛋白生成是诊断多发性硬化(MS)、MOG抗体病(MOGAD)、水通道蛋白4抗体阳性的视神经脊髓炎谱系疾病(NMOSD-AQP4)和自身免疫性脑炎(AE)等中枢神经系统自身免疫性疾病的关键指标IgG寡克隆区带(OCBs)和κ指数是主要诊断工具，其中OCBs被视为金标准在MS诊断中，OCBs和κ指数兼具诊断与预后价值，并具有治疗监测潜力MOGAD和NMOSD-AQP4患者通常表现为OCBs缺失和κ指数阴性，这一特征有助于鉴别诊断OCBs被纳入抗NMDAR脑炎和血清阴性自身免疫性脑炎的诊断标准，同时可作为预后评估指标未来监测方案可能将鞘内免疫球蛋白检测与神经丝轻链蛋白(sNfL)、胶质纤维酸性蛋白(GFAP)等反映神经元与星形胶质细胞损伤的生物标志物联合应用
Microglia protein profiles in CSF across Alzheimer's disease clinical stages - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41814022/分析了阿尔茨海默病（AD）各临床阶段脑脊液中的小胶质细胞蛋白谱。研究纳入两个脑脊液队列（n = 834），鉴定出109种失调的小胶质细胞相关蛋白。临床前AD阶段显示先天免疫过程及细胞募集机制的激活。AD痴呆阶段呈现适应性免疫与巨噬细胞反应特征。筛选出18种关键蛋白组成特征面板，揭示临床前与痴呆阶段的显著差异。研究结果为基于小胶质细胞的AD分期生物标志物开发及动态机制解析提供依据。
Integrated intraocular-plasma proteomics reveals conserved biomarkers for diabetic retinopathy progression: a multi-fluid biopsy study - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41817688/本研究旨在通过微创方法识别糖尿病视网膜病变进展的保守生物标志物。对来自广东糖尿病视网膜病变多组学研究(n=32)的房水进行了高通量蛋白质组学分析。研究确定了时序蛋白簇，发现40个候选生物标志物在糖尿病视网膜病变进展过程中呈现单调变化。在美国数据集中验证了25个生物标志物，其中17个浓度上升，8个浓度下降。单细胞RNA测序定位了15个候选标志物（包括神经丝轻链蛋白NFL）至视网膜神经元和神经胶质细胞。在英国生物银行数据中，血浆NFL可区分糖尿病视网膜病变患者与对照组，并能预测视网膜病变和血管并发症的发生。血浆NFL增强了传统风险因素模型对糖尿病视网膜病变的预测能力。研究确认NFL是可经血浆检测、适用于糖尿病视网膜病变全病程进展的广谱生物标志物。
Association of the endothelial activation and stress Index (EASIX) with cognitive function in United States older adults: Findings from NHANES 2011-2014 - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41815049/该研究探讨了内皮细胞激活和应激指数（EASIX）与老年人认知功能之间的关联。EASIX通过常规实验室指标计算得出：（肌酐×乳酸脱氢酶）/血小板计数。研究分析了2011-2014年NHANES中2143名60岁以上参与者的数据。认知测试包括CERAD词语学习测试、延迟回忆测试、动物流畅性测试（AFT）和数字符号替换测试（DSST）。较高的EASIX评分与多项认知测试中较低的表现显著相关。EASIX显示与认知功能障碍风险增加存在强关联性，尤其在AFT和DSST测试中。研究结果表明EASIX可作为认知老化和衰退的生物标志物。
Biomarkers for selecting biologic therapies in asthma - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41810797/哮喘是一种具有多种炎症通路的异质性慢性呼吸系统疾病。生物制剂疗法改变了中重度哮喘的治疗模式。选择合适的生物制剂仍具挑战性，通常需要尝试性治疗方案。生物标志物对哮喘精准医疗至关重要，可提供疾病机制的客观评估指标。已确立的生物标志物包括血嗜酸性粒细胞计数、呼出气一氧化氮分数和血清总免疫球蛋白E。痰液生物标志物可直接反映气道炎症，但受限于技术复杂性。新兴生物标志物涵盖蛋白质组学、转录组学、代谢组学和基因组学生物标志物。来自电子健康记录和可穿戴设备的数字生物标志物提供了新机遇。社会经济因素被确认为生物制剂疗效的调节因素。整合多种生物标志物对优化生物制剂选择和实现哮喘缓解至关重要。
Proteomic Analysis of Cerebrospinal Fluid from Severe COVID-19 Patients Reveals Prognostic Biomarkers Associated with Disease Outcome - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41830303/对重症COVID-19患者脑脊液的蛋白质组学分析发现，与对照组相比有488种蛋白质发生显著改变。ICU存活者中升高的蛋白质涉及凝血、炎症和血脑屏障功能障碍（如SERPINC1、KNG1、PLG）。非存活者显示出与代谢紊乱、细胞应激和神经炎症相关蛋白质的上调（如FABP3、PDIA4）。通路富集分析强调了重症COVID-19中免疫激活、炎症反应和凝血级联反应。研究结果表明脑脊液蛋白质组学可揭示预后生物标志物，并凸显COVID-19病理生理中的全身性炎症和血脑屏障破坏。
Biologically Younger Individuals, as Identified by MARK-AGE Biological Age Scores, Display a Distinct Favourable Blood Chemistry Profile Regardless of Age - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41823324/MARK-AGE研究在欧洲35-74岁的3300名受试者中识别出衰老生物标志物采用10项女性生物标志物和10项男性生物标志物计算代表生物学年龄的'生物年龄分数'MARK-AGE评分显示生物学年龄更年轻的个体具有更优的血液生化指标，包括更高水平的高密度脂蛋白和维生素D研究发现吸烟女性和唐氏综合征患者生物学年龄更大，而接受激素替代疗法的绝经后女性生物学年龄更小葡萄糖和糖化血红蛋白等标志物与实际年龄相关，但与生物学年龄差异无关，提示其在衰老过程中作用机制不同
Plasma isomiRs as Candidate Biomarkers for Amyotrophic Lateral Sclerosis - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41822037/血浆同源异构miRNA被提出作为肌萎缩侧索硬化症（ALS）的诊断生物标志物。TDP-43参与将微小RNA（miRNA）加工为成熟产物的过程，影响同源异构miRNA的谱系特征。研究比较了同源异构miRNA与经典miRNA对ALS的分类效果，发现前者更具鉴别优势。差异表达分析显示，与miRNA相比，ALS样本中发生异常的同源异构miRNA数量更多。基于同源异构miRNA构建的XGBoost分类器能准确区分ALS样本与对照组及其他神经系统疾病样本。该研究表明同源异构miRNA可提升基于非编码RNA的ALS诊断效能。
Unveiling potential diagnostic biomarkers for rheumatoid arthritis through integrated gene expression analysis - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41816328/通过整合基因表达分析确定了类风湿性关节炎(RA)的潜在诊断生物标志物运用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和机器学习算法(随机森林、SVM-REF、LASSO、CNN)筛选关键基因发现543个差异表达基因(DEGs)，最终锁定273个参与炎症反应通路的关键基因基于AUC值筛选出5个具有高诊断价值的基因(GABARAPL1、FKBP5、PCDH9、SLAMF8)构建预测列线图模型并在RA滑膜组织中验证基因表达免疫浸润分析显示RA患者与健康对照组的免疫细胞水平存在显著差异预测出针对关键基因的潜在治疗药物，包括(+)-白屈菜赤碱、柔红霉素和比沙可啶
Integration of Ki67 and Pan-Immune-Inflammation Value (PIV) into a predictive nomogram for pathologic complete response in triple-negative breast cancer : (Ki67 and inflammation in triple-negative bre2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41814226/研究将Ki67和泛免疫炎症值（PIV）整合进预测三阴性乳腺癌病理完全缓解的列线图模型研究聚焦三阴性乳腺癌的生物标志物分层、免疫微环境及全身炎症反应回顾性研究设计经帕姆卡莱大学非干预性临床研究伦理委员会批准，豁免知情同意因保密要求数据未公开，经申请并获得机构批准后可获取作者声明无利益冲突参考文献涉及乳腺癌预后标志物、治疗靶点探索及新辅助化疗疗效相关研究
Extracellular Vesicle Protein and MiRNA Signatures as Biomarkers for Post-Infectious ME/CFS Patients - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41828537/感染后ME/CFS缺乏明确的病理生理学和诊断方法细胞外囊泡(EVs)携带疾病特异性蛋白和miRNA特征，可改进疾病分析研究重点为从女性ME/CFS患者（含新冠后遗症病例）血浆EVs中识别蛋白质和miRNA生物标志物EVs分离鉴定显示患者与健康对照组在四跨膜蛋白表达上存在微小差异蛋白质组分析揭示ME/CFS患者囊泡货物蛋白改变，如血红蛋白α亚基和胰岛素样生长因子结合蛋白酸不稳定亚基小RNA测序显示新冠后ME/CFS患者hsa-let-7b-5p显著下调，与症状加重相关研究表明EV货物差异（特别是特定蛋白和hsa-let-7b-5p）可作为ME/CFS诊断和分层的有效工具
Circulating Biomarkers of Neurodegeneration and All-Cause and Dementia-Specific Mortality - PubMed2 months agohttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41824925/GFAP和NfL等血液生物标志物与全因死亡率、痴呆特异性死亡率及心血管疾病死亡率风险升高相关该研究纳入了30,239名黑人和白人参与者的双种族队列，平均随访时间为11.1年GFAP与痴呆特异性死亡率的关联性最强（风险比HR 5.66），其次是NfL（风险比HR 2.72）未发现总tau蛋白与死亡率结果存在显著关联研究结果凸显了这些生物标志物在临床实践中评估死亡风险的潜在价值